會計電算化的實施，大大提高了會計信息處理的速度和準(zhǔn)確性，能為用戶提供及時、準(zhǔn)確的會計信息，是會計事業(yè)發(fā)展史上一次史無前例的飛躍。但在這個飛躍也給審計工作帶來很大的影響，歸納起來主要有下列幾方面：
　　
　　一、審計線索的改變
　　
　　由于會計實行電算化，使審計線索發(fā)生很大變化，傳統(tǒng)的手工會計系統(tǒng)中的審計線索在電算化系統(tǒng)中將會中斷甚至消失。在手工系統(tǒng)中，由原始憑證到記賬憑證，由過賬到財務(wù)報表的編制，每一步都有文字記錄，都有經(jīng)手人簽字，審計線索十分清楚。審計人員進行審行，完全可以根據(jù)需要進行順查、逆查或抽查。但在電算化會計系統(tǒng)中，傳統(tǒng)的賬薄沒有了，絕大部分的文字記錄消失了，代之的是存有會計資料的磁盤和磁帶，這些磁性介質(zhì)上的信息是以機器可讀的形式存在的，肉眼不能識別。此外，從原始數(shù)據(jù)進入計算機，到財務(wù)報表的輸出，這中間的全部會計處理集中由計算機按程序指令自動守成，傳統(tǒng)的審計線索在這里中斷了、消失了。傳統(tǒng)的查賬方法，對電算化的會計個體已不完全適用。為了能有效地審計電算化的會計個體，在電算化會計系統(tǒng)的設(shè)計和開發(fā)時必須注意審計需求，要留下新的審計線索。例如，要留下每筆經(jīng)濟業(yè)務(wù)的詳細記錄，而不能只留下更新后的當(dāng)前余額。有些系統(tǒng)中的暫存文件，經(jīng)過一定的時間就要被刪掉。如果審計需要查這些文件，則應(yīng)拷貝，以便查尋。
　　
　　二、會計系統(tǒng)內(nèi)部控制的改變
　　
　　國際上近代的審計都是以系統(tǒng)為基礎(chǔ)的，即審計師要對會計系統(tǒng)的內(nèi)部控制進行審查和評價，以作為制定審計方案和決定抽查范圍的依據(jù)。由于會計系統(tǒng)實現(xiàn)了電算化，手工會計系統(tǒng)原有的內(nèi)容控制已不能適應(yīng)電子數(shù)據(jù)處理的新特點，不能有效地降低電算化會計系統(tǒng)特有的風(fēng)險。例如，在電算化會計系統(tǒng)中，會計信息的處理和存貯高度集中于計算機，會使手工會計系統(tǒng)中的某些職責(zé)分離，互相寄制的控制失效。為了系統(tǒng)的安全可靠和系統(tǒng)處理與存貯的會計信息準(zhǔn)確完整，必須考慮電算化系統(tǒng)的特點，針對其固有的風(fēng)險，建立新的內(nèi)部控制。這些內(nèi)部控制除了有關(guān)電子數(shù)據(jù)處理的制度、規(guī)定和人工執(zhí)行的程序控制外，內(nèi)部控制的程序化是電算化會計信息系統(tǒng)的一個重要特點。如何識別、研究、審查和評價這些新的內(nèi)容控制，尤其是程序化的內(nèi)部控制，是會計電算化給審計提出的又一個新問題。美國注冊會計師協(xié)會發(fā)表的第3號審計準(zhǔn)則概論指出："如果客戶在其會計系統(tǒng)中使用了電子數(shù)據(jù)處理，無論應(yīng)用是簡單的帶是復(fù)雜的，審計員都要充分地了解整個系統(tǒng)， 使得能識別和評價系統(tǒng)的基本會計控制的特點。在包括較復(fù)雜的電子數(shù)據(jù)處理應(yīng)用的情況下，審計員在執(zhí)行必要的審計方案中將要就應(yīng)用專業(yè)化的電子數(shù)據(jù)處理的專門知識"。在會計電算化條件下，由于內(nèi)部控制變化了，審計人員必然研究電算化系統(tǒng)的內(nèi)部控制，掌握其審查方法。對程序控制，審計員要利用計算機輔助審計技術(shù)進行審計。對于電算化會計信息系統(tǒng)內(nèi)部控制的弱點，審計人員要能評估其影響，并向被審單位提出改進的建議。
　　
　　三、審計內(nèi)容的改變
　　
　　在會計電算化條件下，審讓的監(jiān)督職能雖然沒有改變，但審計內(nèi)容卻發(fā)生了變化。在電算化會計信息系統(tǒng)中，會計事項由計算機按程序自動進行處理，如果系統(tǒng)的應(yīng)用程序出錯或被非法篡改，則計算機只會按給定的程序以同樣錯誤的方法處理所有的有關(guān)會計事項，系統(tǒng)就可能被不知，鬼不覺地嵌入非法的舞弊程序，不法分子可以利用這些舞弊程序大量侵吞企業(yè)的財物。系統(tǒng)的處理是否合規(guī)、合法、安全可靠，都與計算機系統(tǒng)的處理和控制功能有直接關(guān)系。電算化會計信息系統(tǒng)的特點，及其固有的風(fēng)險，決定了審計的內(nèi)容要增加對計算機系統(tǒng)處理和控制功能的審查。在會計電算化條件下，審計人員要花費較多的時間和精力來了解和審查計算機系統(tǒng)的功能，以證實其處理的合法性、正確性和完整性，保證系統(tǒng)的安全可靠。 

　　當(dāng)一個系統(tǒng)已經(jīng)完成并投用后，再對它進行改進，比在系統(tǒng)設(shè)計、開發(fā)階段進行困難得多，費用昂貴得多。因此，除要對投用后的電算化會計信息系統(tǒng)進行事后審計處，還應(yīng)提倡在系統(tǒng)的設(shè)計、開發(fā)階段，應(yīng)有審計人員參與進行事前和事中的審計。他們在系統(tǒng)設(shè)計開發(fā)的各個階段要注意審查和考核下列問題：一是系統(tǒng)的功能是否恰當(dāng)、完備、能否滿足用戶核算和管理的要求；二是系統(tǒng)的數(shù)據(jù)流程、處理方法是符合會計制度、法規(guī)、法令和財經(jīng)紀(jì)律的要求；三是系統(tǒng)是否建立了恰當(dāng)?shù)某绦蚩刂?，以防止或及時發(fā)現(xiàn)無意的差錯或有意的舞弊；四是系統(tǒng)是否保留了充分的審計線索，能否為日后順利開發(fā)審計提供必需的條件；五是系統(tǒng)的安全保密措施和管理制度是否健全，能否為系統(tǒng)日后安全可靠地運行系統(tǒng)的開發(fā)控制。審計人員還參與系統(tǒng)的調(diào)試、檢測和驗收，盡可能及時地發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)的問題，及時提出改進意見。

　　四、審計技術(shù)的改變

　　在手工會計處理的條件下，審計可根據(jù)具體情況進行順查、逆查或抽查。審查一般采用審閱、核對、分析、比較、調(diào)查和證實等方法。所有審查工作都是由人工完成的。在會計電算化條件下，會計的特點決定了審計的內(nèi)容和技術(shù)的改變。雖然人工的各種審查技術(shù)仍是很重要的，但計算機輔助審計是必不可少的審計技術(shù)。

　　信息處理的電算化和信息存貯的電磁化，如果沒有全部打印輸出紙質(zhì)的賬表文件，磁性介質(zhì)上的會計資料是肉眼所不能識別的，審計人員只能利用計算機對它進行審查。即使系統(tǒng)的全部賬表都要硬拷貝，利用計算機比手工可以更迅速、更有效地完成審閱、核對、分析、比較等各項審查工作。例如，計算機可以幫助審計人員審閱賬務(wù)文件，找出滿足指定條件的會計記錄；可以對眾多的會計事項進行統(tǒng)計抽樣，以便審計員對缺抽出樣本進一步審查；還可以根據(jù)系統(tǒng)所記錄的會計資料計算出各種財務(wù)比率、變化率和進行各種分析比較等等。
 
　　在會計電算化條件下，既要對計算機系統(tǒng)的處理和控制功能進行審查，又要采用計算機輔助審計技術(shù)。對計算機系統(tǒng)功能的審查，必須運行計算機，讓計算機執(zhí)行各種操作和處理，也就是利用計算機開展審計。此項審查是不能離開計算機僅由人工來完成的。 

　　另一個計算機輔助審計技術(shù)的應(yīng)用是，在電算化會計信息系統(tǒng)的設(shè)計開發(fā)過程中，可事先在被審計的計算機系統(tǒng)中的嵌入審計程序。這些程序可以執(zhí)行審計監(jiān)督，建立審計跟蹤文件，記錄符合指定條件的會計事項及其操作處理的有關(guān)信息，以便日后審計人員踴躍追查。這些程序還可以執(zhí)行一些特殊的審計功能。

　　五、對審計人員的要求更高

　　在會計電算化條件下，由于審計線索內(nèi)容控制、內(nèi)容和審計技術(shù)的改變，決定了對審計人員的要求高了。不懂得計算機的審計人員，因?qū)徲嬀€索的改變而無法踴躍審計；不懂得電算化會計系統(tǒng)的特點和風(fēng)險而不能識別和審其內(nèi)部控制；不懂得使有計算機而無法對計算機進行審查或利用計算機進行審計。因此，要求審計人員不僅要有會計、審計理論和實務(wù)知識，而且要掌握計算機和電算化會計方面的知識和技能。
 
　　由上述可見，會計電算化給審計提出了許多新問題、新要求。傳統(tǒng)的手工審計已不能適應(yīng)電算化的要求。學(xué)習(xí)、研究和開展計算機審計是審計部門和審計人員的新課題和新任務(wù)。